El sector se encarga de la gestión administrativa y contable de los recursos económicos asignados a las 27 unidades ejecutoras, investigadores o grupos de investigación mediante el manejo de los fondos destinados a funcionamiento y equipamiento de dichas unidades, y a la subvención de los proyectos de investigación plurianuales (PIP).

También se administran los subsidios de Cooperación Internacional  y todos los ingresos por Fondos No CONICET.

La responsable del área es la contadora Claudia Pergolezi.